心肌梗死模型大鼠心肌组织基因表达变化及缝隙连接相关基因分析1)
基因芯片,差异基因,引物,1材料与方法,2结果,3讨论
吴爱明,翟建英,张冬梅,娄利霞,朱海燕,赵明镜,王硕仁心肌梗死(MI)是威胁人类健康的主要疾病之一[1],在我国发病率呈现逐年升高趋势[2]。虽然随着MI后再灌注治疗的普及,患者早期死亡率大幅降低[3],但是幸存的MI患者仍具有发生致死性心律失常的潜在风险[4]。这与基因的改变和调控密不可分。因此,有必要从基因水平研究MI后心律失常的发生机制,以进一步降低MI患者的猝死率。本研究制作MI大鼠模型,进行了左心室心肌组织的全基因组表达谱芯片检测和分析,并采用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)方法验证了心肌细胞间缝隙连接通路相关的3条基因,旨在为进一步从基因水平认识MI后心律失常发生的分子机制提供实验依据。
1 材料与方法
1.1 实验动物 雄性SD大鼠,平均体重220g~250g,由北京维通利华实验动物技术有限公司提供,许可证编号:SCXK(京)2002-0003。
1.2 主要仪器 RSP1002型呼吸机(美国Kent公司),心电示波仪(上海医学电子仪器厂),杂交炉(美国Agilent公司),扫描仪(美国 Agilent公司),分光光度计(美国Nanodrop公司),Realtime PCR仪(美国Stratagene公司)。
1.3 主要试剂 RNA提取试剂盒(美国Promega公司),RT试剂盒(美国Promega公司),SYBER Green染料(美国ABI公司)。Agilent大鼠全基因组表达谱芯片(生物芯片上海国家工程研究中心)。
1.4 动物模型制备与分组方法 大鼠随机分为模型组和假手术组,参照文献[5]制作 MI大鼠模型,用戊巴比妥钠(50mg/kg)麻醉,固定备皮,气管插管,连呼吸机和心电图仪。在左胸第三、四肋间开胸约1.5cm,用眼科弯镊轻提左心耳,在动脉圆锥与左心耳之间下约1mm处用5/0手术线结扎左冠状动脉前降支,迅速关胸缝合。心电图Ⅱ导联显示ST段显著抬高表示结扎成功。假手术组只穿线,不结扎。术后常规饲养1个月取材。
1.5 心肌组织的基因芯片检测和生物学信息分析方法 由生物芯片上海国家工程研究中心完成。首先提取心肌组织样本的总RNA,质检合格后进行总RNA纯化,cDNA合成,cRNA合成,cRNA纯化 ......
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