基于网络药理学的西洋参、丹参组方抗血栓活性成分及作用机制研究
丹参酮,1方法,2结果,3讨论
网络药理学概念[1]最早于2007年由Andrew L Hopkins在Nature Biotechnology上提出,内容涉及蛋白组学、基因组学、系统生物学、计算生物学和网络生物学等多学科,是在现代药理学基础上建立的以系统生物学为基础的药物设计与开发的新方法。通过构建“药物-靶点-疾病”关系网络,运用专业网络分析软件及算法,系统分析成分-靶点关系,从网络层面观察中药成分对疾病靶点的干预与影响,从而阐明中药多成分、多靶点、多通路的特征。网络药理学已成为目前药物研发理论方法的热点[2-3]。近年来,我国心脑血管病患病率处于持续上升阶段[4],血栓形成和血栓栓塞是心脑血管病的重要病理过程,参与多种疾病的发生与发展。血小板活化聚集、血液黏度升高等是血栓形成关键的病理因素,也是抗血栓药物的研究方向[5]。中医理论中血瘀证见于多种疾病,其临床表现与现代医学的血栓性疾病类似。益气活血作为血瘀证的治法之一,在治疗血栓性疾病中取得了良好的效果。相较于西药的单靶点、高选择性,中药多靶点、多途径相互作用一直是新药研发的热点。组方中西洋参益气以助气行血、丹参活血以免壅滞,且两药合用活血而不耗气、益气而不壅滞,抗血栓疗效明确,因而被广泛用于防治心脑血管疾病,但是其药效的物质基础和作用机制不明,因此,本研究通过网络药理学的方法分析、预测西洋参、丹参组方抗血栓药效物质基础、作用靶点及机制,以期为本课题组后续西洋参、丹参组方抗血栓基础实验研究提供参考依据。
1 方 法
1.1 丹参、西洋参成分潜在靶点网络构建 Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP数据库)[6]是西北农林科技大学王永华教授团队研发的中药系统药理学分析平台,为中药研究提供了新的方法。在数据库中检索西洋参、丹参所有成分及靶点,通过口服生物利用度(OB)、药物相似性(DL)进行活性成分筛选。其中西洋参活性成分指标设定为OB>30%、DL>0.18,丹参活性成分筛选指标设定为OB>40%、DL>0.18,再通过Cytoscape3.2.1软件对成分、潜在靶点进行可视化网络构建。
1.2 血栓性疾病靶点网络构建 以“thrombosis”为关键词分别检索TTD、DrugBank数据库,获得疾病靶点,通过Uniprot数据库进行蛋白基因名的转换,再通过Cytoscape3.2.1软件进行疾病靶点可视化构建,利用Bisogenet构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络 ......
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