当前位置: 首页 > 期刊 > 《中西医结合心脑血管病杂志》 > 2022年第9期
编号:209021
基于分子对接和网络药理学探讨半枝莲治疗脑梗死的作用机制
http://www.100md.com 2022年6月1日 中西医结合心脑血管病杂志 2022年第9期
槲皮素,脑缺血,黄芩,1资料与方法,2结果,3讨论
     聂玉婷,张 磊,司 童,刘 瑶,高 利,曲 淼

    脑卒中是世界第二、我国首位的死亡原因,且我国人群脑卒中发病率明显高于世界平均水平[1]。缺血性脑卒中占脑卒中的80%以上,脑卒中后病人大部分遗留残疾,失去工作和生活的能力,给社会和国家造成严重的经济负担。急性脑梗死损伤机制涉及氧化应激、炎症反应、细胞凋亡等多个途径,但是目前多数药物只能针对急性脑梗死病理过程的某一环节,因此,多靶点药物研发迫在眉睫。半枝莲具有清热解毒、活血祛瘀、利尿消肿等功效。有研究表明,半枝莲总黄酮可在一定程度上降低轴索过度生长抑制因子的表达,改善脑缺血小鼠的认知功能[2]。张立波等[3]研究发现,半枝莲总黄酮能减轻急性脑梗死缺血再灌注大鼠大脑皮层神经炎症反应,减轻神经元损伤。沈宏友等[4]给予脑缺血再灌注损伤大鼠半枝莲总黄酮(140 mg/kg)灌胃治疗,发现其可以通过调控细胞凋亡减小脑梗死体积。本研究旨在探索半枝莲治疗脑梗死的网络药理学机制,进一步明确半枝莲治疗脑梗死的作用机制。

    1 资料与方法

    1.1 筛选半枝莲的关键化合物 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP,https://tcmspw.com/tcmsp.php),以“半枝莲”为关键词,以口服生物利用度(OB)>30%和药物相似性(DL)>0.18 为条件筛选主要有效活性成分及相应靶点,通过 UniProt 数据库(https://www.uniprot.org)对靶点进行注释。

    1.2 疾病靶点筛选 以“cerebral infarction”为关键词在 GeneCards(https://www.genecards.org)与 OMIM(https://omim.org)数据库进行检索,Relevance score设置为≥3,去除重复靶点,筛选脑梗死的疾病靶点。通过R语言包install.packages(“Venn Diagram”),得到半枝莲-脑梗死共同靶点基因。

    1.3 药物-关键化合物-疾病靶点的网络可视化 使用 Cytoscape 3.7.2 软件进行可视化处理,构建“半枝莲-关键化学成分-脑梗死-靶蛋白”网络关系图。

    1.4 靶蛋白互作(PPI)网络构建 将半枝莲-脑梗死共有的靶点基因输入String(https://string-db.org/cgi/input.pl)建立靶蛋白互作网络图,将蛋白关系评分设为 0.4,隐藏游离蛋白,得到 PPI 网络图。选取前 20个邻接点最多的基因,用 R 语言绘制柱状图。

    1.5 基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析 利用 R 软件安装 Bioconductor相关安装包(“DOSE”“clusterProfiler”“pathview”) ......

您现在查看是摘要页,全文长 9904 字符