基于网络药理学和分子对接分析小续命汤治疗阿尔茨海默病的作用机制
槲皮素,靶点,1资料与方法,1小续命汤有效成分与靶点预测,2AD疾病相关靶点的获取,3小续命汤治疗AD潜在靶点蛋白质相互作用(PPI)网络构建及拓扑分析,4关键成分通路富集分析,5利用AutoDo
邹旭欢,付雪琴,王玮玮,王漫漫,兰 瑞阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)是一种以感觉或运动功能丧失、记忆力减退和痴呆症为主要表现的神经系统退行性改变,多发于中老年人,占全部痴呆类型的60%~80%[1]。我国2015—2018年AD患病率为6.6%,根据国家人口预测,2050年AD患病人数约为3 003万人,其病理学特征为淀粉样蛋白(amyloid-beta peptide,Aβ)沉淀形成的老年斑和tau蛋白的过度磷酸化形成的神经细胞内神经原纤维缠结,组织病理学研究显示,AD神经元细胞骨架不规则、突触异常[2-4]。AD病情的发生、发展与线粒体突触功能失常、Aβ的形成和积累、Tau蛋白的过度磷酸化、miRNA的失调、突触损伤、氧化应激、炎症反应、乙酰胆碱(acetylcholine,ACh)的缺失等密切相关[5]。目前,尚无特效药物可治愈或逆转AD的疾病过程,仅能减轻症状、延缓病情发展。小续命汤首见于孙思邈的《千金要方》,由12味药组成,历代医家常用来治疗中风病,现有的临床及动物实验表明,小续命汤可保护脑卒中后的神经血管单元、神经元细胞、线粒体等,除此之外,也在降血脂、抗凝血、改善学习记忆能力方面具有重要作用[6]。基于中医辨证施治的“异病同治”理论,研究发现,提取出的小续命汤有效成分组对β-淀粉样蛋白片段、L-谷氨酸、过氧化氢的损伤具有保护作用,且采用高效液相色谱法能够快速有效地分析小续命汤抗AD成分中的有效成分,为小续命汤治疗AD提供了可行的理论支撑[7-8]。小续命汤药物味数多、成分复杂,目前关于小续命汤治疗AD的具体作用机制尚未明确。因此,本研究采用网络药理学方法预测小续命汤有效成分治疗AD的潜在靶点和作用机制,并通过分子对接技术进行验证。
1 资料与方法
1.1 小续命汤有效成分与靶点预测
在中药系统药理学数据库和分析平台(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php,TCMSP)中查询药物的有效活性成分,并以通用的口服利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为筛选标准进行初筛,核查去重后,获得小续命汤总的有效活性化合物。在UniProt数据库中进行靶点基因名转换,去重后获得小续命汤的靶点基因。
1.2 AD疾病相关靶点的获取
以“阿尔茨海默病(Alzheimer disease)”为检索词分别挖掘在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、基因名片(GeneCard)数据库获得AD的潜在治疗靶点,合并数据库靶点,去重后获得总的AD靶点 ......
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