基于网络药理学探讨干姜附子汤抗心肌缺血再灌注损伤的作用机制
靶点,1材料,1仪器及试药,2细胞种类及来源,2方法,1干姜附子汤中候选活性化合物与靶点的收集与筛选,2MI,RI靶点的收集,3干姜附子汤抗MI,RI的PPI网络构建,4GO富集分析和KEGG富集分析
谢锋,段广靖,王斌,卫培峰,陈琳,李敏(陕西中医药大学,陕西 咸阳 712046)心肌缺血再灌注损伤(myocardial ischemia-reperfusion injury,MI/RI)[1]是指缺血缺氧的心肌组织恢复血液供应后,心脏结构的进一步破坏以及心肌细胞能量代谢功能障碍的进一步加重,甚至发生不可逆性损伤,主要包括心肌梗死面积的再扩大和危及生命的心律失常。目前,MI/RI的发病机制尚未完全阐明,一般认为钙超载、凋亡、氧化损伤、炎症是MI/RI 发生的重要原因[2-3]。
干姜附子汤记载于《伤寒杂病论?太阳病篇》,由干姜和附子配伍组成,相须使用可增强回阳救逆的功效,主治亡阳欲脱及中虚寒盛证。现代药理学研究表明,干姜附子汤具有抗休克、强心、增加冠状动脉血流量等作用[4-5]。史琴等[6]研究显示,干姜附子汤可降低MI/RI 大鼠心电图ST 段及心肌缺血面积。血清中乳酸脱氢酶(LDH)、心肌肌钙蛋白Ⅰ(cTn-I)及肌酸激酶同工酶(CKMB)含量明显下降,提示干姜附子汤对MI/RI 大鼠有保护作用,但其生物过程及具体机制仍不清楚。网络药理学(network pharmacology)是研究中药复方多成分、多靶点、多通路作用机制的重要手段[7-11],本研究拟通过网络药理学对干姜附子汤治疗MI/RI 的作用机制进行预测分析并进行实验验证,为其深入研究提供基础。
1 材料
1.1 仪器及试药
胎牛血清(美国Kirge 公司,批号:20190907);ATP 酶试剂盒(碧云天生物科技有限公司,批号:20191205);细胞凋亡检测试剂盒(南京建成生物工程研究所,批号:20200102);ELx808 全自动酶标仪(美国BIOTeK 公司);流式细胞仪(美国Thermo Fisher 公司);淡附片(附子炮制品)(批号:190301)、干姜(批号:190201)(咸阳市北京同仁堂药店,经陕西中医药大学中药鉴定教研室张岗教授鉴定为正品)。
1.2 细胞种类及来源
大鼠心肌细胞株H9C2 细胞(武汉博士德生物工程有限公司,货号:CX0125)。
2 方法
2.1 干姜附子汤中候选活性化合物与靶点的收集与筛选
以附子、干姜为关键词在中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php)中检索附子、干姜的化学成分。以口服生物利用度(OB)≥30%,药物相似性(DL)≥0.18为标准[12] ......
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