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编号:13547293
靶向肝癌细胞HepG2和SMMC-7721核酸适配体的筛选及鉴定(2)
http://www.100md.com 2019年6月1日 《青岛大学学报(医学版)》 20193
     1.1.2文库及引物初始文库Gp30,由两端的固定序列和中间30个nt的随机序列组成,其中Pstemloop-tgatt划线部分序列可形成发卡结构,与Plong-1 tgtc引物在PCR过程中阻止正链延伸,可产生不等长PCR产物[21],从而制备单链次级文库投入下一轮筛选。Plong-1 tgtc与P11-tgatt用于扩增双链产物,便于富集文库克隆至pGM-T质粒载体测序获得单克隆序列。见表1。以上文库、引物及FAM标记适配体序列均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成、修饰。

    1.2方法

    1.2.1Cell-SELEX筛选ssDNA文库(原始文库或次级文库)100 ℃变性5 min,立即冰浴10 min。加入筛选缓冲液各组分,最终孵育体系内含有:1×PBS、1 mmol/L浓度MgCl2、0.1 g/L的酵母tRNA、0.1 g/L鲑鱼精DNA和所需要的ssDNA文库。将预先处理好的ssDNA文库加入接种于96孔板的靶细胞(HepG2或SMMC-7721 ......
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