方燕 郑晓雪

    【摘要】近年来，对多组学层进行综合分析的要求日益突出，从而产生了一些多组学富集工具。每种方法在通用性方面都有缺点和局限性。在此，基于GSEA程序包以帮助在多个组学层上计算基于基因集富集分析的组合途径富集，该软件包查询8个不同的路径数据库，并依赖基因集富集分析算法进行单组学富集分析。最后，将这些分数相结合，以创建可靠的复合多组学途径富集措施。

    【关键词】基因集富集分析;数据分析;全基因组表达谱芯片

    1基因集富集分析(GSEA)的相关概述

    某种治疗的分子反应或深入了解临床表型时，基因集或途径富集技术是从高维分子组学数据推断机械生物学信息的首选工具。通过不同的统计技术，如过度代表性分析(ORA)或GSEA，能够识别特定的基因集或特定治疗或疾病引发的分子反应/信号途径。这些集合可能代表特定的分子功能，如基因本體论(GO)、生物学过程或实验衍生的基因集所定义 ......