1.3 VNTR位点选择和操作步骤、方法

    参见文献[3-4]。

    1.4 数据分析

    输入至电子表格的菌株VNTR数据,用BioNumerics 4.5软件进行分析,得出聚类分析图。

    2 结果

    228株临床分离结核分枝杆菌根据VNTR重复次数,经BioNumerics(Version3.0)软件聚类分析后被分为4大基因群,分别包含菌株23、1、202、2株菌,其中最大的基因群为北京家族基因型,共包含202株结核分枝杆菌。主要基因类型有7个,分别包含13(5.7%)、3(1.3%)、7(3.1%)、1(0.4%)、171(75.0%)、31(13.6%)、2(0.9%)个株菌;在株水平分类上228株结核分枝杆菌被分为132个基因型,其中93株为单菌株独立基因型,其余135株菌分属39个基因型,各包含2～10株菌。

    3 讨论

    本研究中笔者选取了228株2005～2007年甘肃省兰州市肺科医院临床分离的结核分枝杆菌不同分类菌株作为研究对象,菌株构成具有较强的代表性,基本包含了近年来本地区的流行菌株 ......