丙型肝炎病毒高变区1氨基酸序列差异与丙型肝炎患者生化指标间的相关性分析
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2013年6月25日
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迟淑萍 由莉越 张诗龙 刘军 吴素体 孙杰 周婷婷 杜丽 程云 解放军第三〇二医院药学部研究室;军事医学科学院基础医学研究所;
【摘要】目的研究丙型肝炎高变区1(HCV HVR1)氨基酸序列间的差异性以及此差异与生化指标间的相关性。方法以81例丙型肝炎患者氨基酸序列为材料,按照序列同源性进行分组,利用序列对比方法分析氨基酸的变异规律,同时利用生物信息学的手段分析氨基酸序列与丙型肝炎生化指标间的相关性。结果 HCV HVR1氨基酸序列保守性差,其中aa17、aa21的芳香氨基酸丰度高;各个生化指标与序列差异具有一定的相关性,在各组中相关性不尽相同。结论在病理变化过程中,生化指标的改变不可作为患者体内丙型肝炎病毒氨基酸序列发生变异的标志指标。
【关键词】 氨基酸序列 丙型肝炎病毒 相关性 生化指标
【基金】国家科技重大专项重大新药创制课题(编号2009ZX09102-001)
【分类号】R512.63
丙型肝炎病毒(HCV)一直危害世界人类健康,约有75%的病毒感染者会发展成为慢性丙型肝炎,而其中又会有很大一部分人最终发展为肝硬化和肝癌[1]。HCV的E2区是整个HCV基因组中变异最大的部分,尤其是位于E2蛋白N端的约27个残基,即HVR1(hypervariable region 1)。迄今为止,每一次分
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