人preproEGF的mRNA/cDNA序列中SNPs及生物信息学分布探究(1)
人preproEGF的mRNA,cDNA序列中SNPs及生物信息学分布探究,同位单核苷酸多态,人表皮生长因子前体蛋白,非同位单核苷酸多态
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[摘要] 目的 探明单核苷酸多态(SNPs)在人表皮生长因子前体蛋白(preproEGF)mRNA/cDNA序列中的分布状况。 方法 凭借美国生物信息中心(NCBI)平台和单核苷酸多态资料库(dbSNP)检索、分析、标注和图解相关SNPs在人preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的分布位点和生物信息学特征。 结果 分布在人肾源和其他组织源preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的SNPs总计有106个，其中84个同位SNPs大多数以外显子6～8、11～12、16～19和22～23为间隔并集中归位于第1～5、10、13～15、20～21、24外显子序列中，另外的22个非同位SNPs大多数以密集丛簇为特征而各自分布在两类序列3'端非编码序列中，但个别例外则单独归位于肾源类序列的第9外显子中。 结论 SNPs在人两类preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的生物信息学分布、特征和图示对于SNP与疾病或性状的相关性研究及课题设计颇具参考价值。
[关键词] 同位单核苷酸多态；人表皮生长因子前体蛋白；非同位单核苷酸多态；生物信息学
[中图分类号] R786 [文献标识码] A [文章编号] 1673-7210(2014)01(a)-0014-05
人表皮生长因子前体蛋白(prepro-epidermal growth factor，preproEGF)mRNA/cDNA序列由24个外显子组成，长约5 kb，编码一条1207个氨基酸的蛋白多肽链，该肽链在翻译生成后经蛋白酶剪切加工形成的成熟表皮生长因子(一段53个氨基酸多肽)对人体表皮细胞的生长、分化和代谢起着十分重要的作用[1] ......
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陈海明 李方明 张兵 刘祖明 毛贵川 王兴林 刘金伟 杨绍华 贵州省黔西南州人民医院遵义医学院第七附属医院;遵义医学院附属医院贵州省细胞工程实验室;海口市保税区远兮细胞分子技术应用研发有限公司;
【摘要】目的探明单核苷酸多态(SNPs)在人表皮生长因子前体蛋白(preproEGF)mRNA/cDNA序列中的分布状况。方法凭借美国生物信息中心(NCBI)平台和单核苷酸多态资料库(dbSNP)检索、分析、标注和图解相关SNPs在人preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的分布位点和生物信息学特征。结果分布在人肾源和其他组织源preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的SNPs总计有106个,其中84个同位SNPs大多数以外显子6~8、11~12、16~19和22~23为间隔并集中归位于第1~5、10、13~15、20~21、24外显子序列中,另外的22个非同位SNPs大多数以密集丛簇为特征而各自分布在两类序列3'端非编码序列中,但个别例外则单独归位于肾源类序列的第9外显子中。结论 SNPs在人两类preproEGF多肽mRNA/cDNA序列中的生物信息学分布、特征和图示对于SNP与疾病或性状的相关性研究及课题设计颇具参考价值。
【关键词】 同位单核苷酸多态 人表皮生长因子前体蛋白 非同位单核苷酸多态 生物信息学
【基金】遵义医学院第七附属医院(贵州省黔西南州人民医院)科研基金[编号(2009)84]
【分类号】R341
人表皮生长因子前体蛋白(prepro-epidermal growthfactor,preproEGF)mRNA/cDNA序列由24个外显子组成,长约5 kb,编码一条1207个氨基酸的蛋白多肽链,该肽链在翻译生成后经蛋白酶剪切加工形成的成熟表皮生长因子(一段53个氨基酸多肽)对人体表皮细胞的生长、分化和代谢起着十分重
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