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编号:13327684
基于KEGG通路和基因网络对慢性萎缩性胃炎靶点基因的筛选(1)
http://www.100md.com 2019年1月15日 《中国医药导报》 2019年第2期
基于KEGG通路和基因网络对慢性萎缩性胃炎靶点基因的筛选,基因互作网络,富集分析
     [摘要] 目的 运用DAVID数据库得到通路和基因的相关信息,分析出重要基因的功能和分布,筛选出与慢性萎缩性胃炎(CAG)相关的靶点基因,促进对CAG发病机制的研究以及新药的开发。 方法 2018年6月以“chronic atrophic gastritis”为关键词在NCBI数据库中检索CAG的相关基因,将得到的基因数据导入DAVID数据库,得到基因富集的通路数据。15个非冗余基因富集在20条KEGG通路上进行了分析,将15个基因输入String数据库做相互作用的网络图,将富集在通路上的关键基因也做网络图,并且将这两个网络图进行比较。 结果 在两张网络图中,FASLG、FAS、ICAM1、IL1B、AKT1、STAT3、TGFβ1、IL4R、IL11、IL23A是位于关系度排名靠前的基因 ......
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