小鼠Rdh13基因的组织表达谱及其亚细胞定位的初步观察
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周佳 陈燕 赵晓萍 吴晓林 张洪信 邓春光 王铸钢 上海交通大学医学院医学遗传学教研室;上海南方模式生物研究中心;
【摘要】目的:研究视黄醇脱氢酶13(Rdh13)基因在小鼠组织中的表达谱及其亚细胞定位,为其功能研究提供线索。方法:利用生物信息学方法模拟Rdh13的三维结构,采用半定量RT-PCR和Western blot的方法检测小鼠14种组织中Rdh13的表达水平;采用Western blot的方法检测其亚细胞分布;进一步应用免疫荧光共定位的方法观察Rdh13的亚细胞定位。结果:Rdh13具有SDR家族保守的辅酶结合位点(TGX3GXG)和催化活性位点(YX3K);RT-PCR和Western blot实验证实Rdh13在小鼠多种组织中广泛表达,但其表达水平存在一定差异;不同于其它RDHs家族成员,Western blot和免疫荧光共定位提示Rdh13蛋白在细胞中定位于线粒体。结论:Rdh13是一个与Rdh12结构相似的SDR家族成员,在小鼠多个组织中广泛表达;Rdh13蛋白定位于线粒体,有可能作为保护线粒体不受视黄醛毒性作用的屏障。
【关键词】 视黄醇脱氢酶 组织表达谱 亚细胞定位 线粒体
【分类号】Q343
前言视黄醇脱氢酶13(Retinol dehydrogenase 13,Rdh13),位于小鼠7号染色体A1,含有7个外显子,是最近被RIKEN小鼠基因百科全书计划(The RIKEN Mouse Gene EncyclopaediaProject)鉴定的SDR(short chain dehydrogenase/reductase)超家族成员之一[1-4]。RDH13的氨基酸序列与RDH11、
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摘要目的：研究视黄醇脱氢酶13(Rdh13)基因在小鼠组织中的表达谱及其亚细胞定位，为其功能研究提供线索。方法：利用生物信息学方法模拟Rdh13的三维结构，采用半定量RT-PCR和Westem blot的方法检测小鼠14种组织中Rdh13的表达水平；采用Western blot的方法检测其亚细胞分布；进一步应用免疫荧光共定位的方法观察Rdh13的亚细胞定位。结果：Rdb13具有SDR家族保守的辅酶结合位点(TGX3GXG)和催化活性位点(YX3K)；RT-PCR和Western blot实验证实Rdh13在小鼠多种组织中广泛表达，但其表达水平存在一定差异；不同于其它RDHs家族成员，Western blot和免疫荧光共定位提示Rdh13蛋白在细胞中定位于线粒体。结论：Rdh13是一个与Rdh12结构相似的SDR家族成员，在小鼠多个组织中广泛表达；Rdh13蛋白定位于线粒体，有可能作为保护线粒体不受视黄醛毒性作用的屏障。
关键词：视黄醇脱氢酶13；组织表达谱；亚细胞定位；线粒体
中图分类号：R34，Q812 文献标识码：A 文章编号：1673-6273(2009)13-2432-04
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