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编号:300949
利用生物信息学分析开发luminal型乳腺癌自噬相关基因预后模型
http://www.100md.com 2021年6月16日 中国医药生物技术 2021年第3期
样本,1材料与方法,1数据获取和预处理,2方法,3统计学处理,2结果,1差异表达ATGs的鉴定,2差异表达的ATGs功能富集,3预后模型的构建和验证,4预后模型的临床相关性分析,3讨论
     汤倩倩,邵尤城,魏蕾,张京伟

    论著·

    利用生物信息学分析开发luminal型乳腺癌自噬相关基因预后模型

    汤倩倩,邵尤城,魏蕾,张京伟

    430071 湖北,武汉大学中南医院甲状腺乳腺外科(汤倩倩、张京伟),医学院病理生理学教研室(邵尤城、魏蕾)

    建立基于大规模自噬相关基因的 luminal 型乳腺癌预后预测模型。利用 TCGA 数据库乳腺癌数据,分别筛选 luminal 型与非 luminal 型乳腺癌、癌旁组织中差异表达的自噬相关基因。单因素和多因素 Cox 回归建立 luminal 型乳腺癌自噬相关基因预后模型。Kaplan-Meier 曲线和生存依赖的受试者工作特征曲线评估预后模型的准确性。基于差异表达自噬相关基因,建立了一个 3 基因(BAG1、CD46、DIRAS3)预后模型预测 luminal 型乳腺癌患者总生存期。3 年、5 年和 10 年的曲线下面积分别为 0.708、0.752 和 0.837。3 基因预后模型可以有效预测 luminal 型乳腺癌患者预后,或许今后可为 luminal 型乳腺癌的临床治疗提供决策依据。

    luminal 型乳腺癌; 内分泌耐药; 自噬; 预后模型

    在美国,女性乳腺癌发病率每年仅以 0.3% 的速率增加,且其死亡率在持续下降,已次于肺癌[1]。然而,在中国乳腺癌发病率和死亡率却在逐年上升[2]。从全球的角度来看,乳腺癌的高发病率和高死亡率仍然居高不下[3]。乳腺癌的肿瘤发生和治疗是高度异质性的,探索乳腺癌的分子机制,特别是分子亚型已成为乳腺癌研究的核心。目前临床广泛使用的乳腺癌分子分型为:luminal A(ER+和/或 PR+,HER2?);luminal B(ER+和/或 PR+,HER2+);her2(ER?,PR?,HER2+)和三阴性(ER?,PR?,HER2?)[4-6]。其中,luminal 型乳腺癌(luminal A 和 luminal B)占乳腺癌的大多数[7]。目前,内分泌治疗是 luminal 型乳腺癌有效的治疗策略。然而,内分泌治疗耐药现象十分常见,在临床实践中占 20% ~ 30%[8]。此外,研究表明,在完成 5 年的辅助内分泌治疗后,乳腺癌复发的风险持续 15 年[9]。内分泌抵抗机制的研究已经有了突破,针对其中一些机制的靶向抑制剂已经合成并用于临床治疗[10],然而靶向抑制剂的耐药仍然不可避免[11]。因此,探索治疗内分泌抵抗的新分子靶点迫在眉睫。

    自噬,是一高度保守的分解代谢过程,在各种机体过程中起重要作用 ......

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