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编号:300913
SARS-CoV-2棘突蛋白特异性多肽的筛选及初步验证
http://www.100md.com 2021年10月18日 中国医药生物技术 2021年第5期
表位,抗原,1材料与方法,2方法,3统计学处理,2结果,1BLAST分析结果,2SARS-CoV-2S蛋白特异性多肽软件筛选结果,3特异性多肽的理化性质,疏水性及二级结构分析,4SARS-CoV-2S蛋白
     黄明柳,赖小敏

    作者单位:510080 广州,中山大学中山医学院微生物学教研室/热带病防治研究教育部重点实验室/结核病研究所/海洋微生物功能分子广东省高校重点实验室/广东省重大传染病预防和控制技术中心

    新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19 )由新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起[1]。SARS-CoV-2 快速的传播能力让医务工作者筛查潜伏感染者面临着巨大压力。目前主要通过核酸检测来确诊病例,但核酸检测耗时长,患者病程、标本采集、病毒核酸提取过程都有可能干扰核酸检测结果,使核酸检测结果出现“假阴性”,易发生漏诊[2-5]。SARS-CoV-2 抗原/抗体检测方法,在某种程度上更方便快捷,且能弥补核酸检测漏检的风险。但市面上 SARS-CoV-2 抗原/抗体检测试剂盒都存在出现“假阳性”的问题,使其只能作为新型冠状病毒核酸检测阴性疑似病例的补充检测指标,不能用于一般人群检测。除了类风湿因子(rheumatoid factors,RF)、嗜异性抗体(heterophilic antibodies,HA)、补体等因素干扰,使抗原/抗体检测结果出现“假阳性”外,人冠状病毒之间的免疫交叉反应也可能是 SARS-CoV-2 抗原/抗体检测出现“假阳性”的重要原因[6-9]。

    能引起人类感染的冠状病毒有 7 种,即人冠状病毒 229E ( human coronavirus 229E ,HCoV-229E)、人冠状病毒 HKU1(HCoV-HKU1)、人冠状病毒 NL63(HCoV-NL63)、人冠状病毒OC43(HCoV-OC43)、严重急性呼吸系统综合征冠状病毒( severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARS-CoV)、中东呼吸综合征冠状病毒(Middle East respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV),以及此次引起全球大流行的SARS-CoV-2[10]。有分析指出,这 7 种冠状病毒的棘突蛋白(spike protein,S protein)和核衣壳蛋白(nucleocapsid protein,N protein)氨基酸序列同源性达 20%~90%,同时也有实验证明不同种的冠状病毒 N 蛋白或 S 蛋白存在免疫交叉反应[11-21]。这提示 SARS-CoV-2 抗原/抗体检测也可能受其他冠状病毒的影响 ......

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