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编号:13550923
基于网络药理学的“川芎-延胡索”药对作用机制研究(2)
http://www.100md.com 2019年5月15日 《世界中医药》 201910
     1.3 “活性成分-靶点”相互作用网络的构建与分析 再次通过TCMSP平台检索“1.2”中筛选出的活性成分的潜在靶点,使用Uniprot数据库,将潜在靶点蛋白名称校正为物种为人的官方名称(Officical Symbol)。利用Cytoscape3.6.0统计软件构建“活性成分-靶点”相互作用网络模型并使用Network Analyzer插件对网络进行分析,查明网络中化合物和靶点的权重。

    1.4 “川芎-延胡索”药对蛋白相互作用网络构建与分析 String数据库(https://string-db.org,Version 10.5)[4]是一个收集了大量蛋白相互作用关系的数据库,其中包含了经过实验验证和通过生物信息学方法预测得到的数据,共涉及9 643 763个蛋白,1 380 838 440个相互作用。将“川芎-延胡索”药对活性成分作用的蛋白靶点导入String数据库,限定物种为人,获取蛋白相互作用关系,结果保存成TSV格式,导入Cytoscape3.6.0统计软件绘制相互作用网路。首先对此蛋白互作网络进行总体分析,然后使用Cytoscape3.6.0统计软件中的cytohubba插件确定最重要的10个蛋白互作关系 ......
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