基于iTRAQ 技术的肝癌细胞蛋白质组学研究
糖基化,细胞株,1材料与方法,1细胞,2主要仪器与试剂,3细胞培养,4细胞蛋白质谱分析,5差异蛋白的分类及其功能分析,6统计学方法,2结果,1差异蛋白的筛选,2差异蛋白的GO分析,3差异蛋白的KEGG分析,4差异蛋
关媛月 高玉雪 庄 园 陈德喜 王延军首都医科大学附属北京佑安医院北京市肝病研究所,北京 100069
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)是一种以体液和血液传播为主的嗜肝DNA 病毒[1],HBV 持续感染所致的肝癌是影响全球的一个重大健康问题,全世界至少超过3.5 亿是慢性HBV 的感染者[2],每年有约887 000 人死于HBV 相关的肝病。尽管已证实核苷(核苷酸)类似物(NAs)和聚乙二醇化干扰素-α(Peg-IFNα)可有效抑制HBV 复制,但NAs 需要长期服用,α 干扰素(IFNα)治疗则易产生各种副作用,且这两种药物均难以根除HBV,实现慢乙肝的临床治愈[3]。因此,研究HBV 感染相关特异性蛋白标志物,寻找新的药物治疗靶点,对于临床具有重要的意义和价值。本研究使用同位素标记相对和绝对定量(isotope tagging for relative and absolute protein quantitation,iTRAQ)技术对稳定表达HBV 的HepG2.2.15 细胞株及其亲本HepG2 细胞株进行鉴定和定量分析,筛选出差异蛋白,通过生物信息学分析差异蛋白功能及相应通路,为进一步探讨HBV 致病的分子机制提供参考依据。
1 材料与方法
1.1 细胞
HepG2 和HepG2.2.15 的肝癌细胞系于北京市肝病研究所保存。
1.2 主要仪器与试剂
高效液相色谱仪(Nano,HPLC)、Durashell-C18色谱柱(4.6 mm×250 mm,5 μm ......
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