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编号:13473508
基于网络药理学的左金丸治疗胃癌作用机制研究(3)
http://www.100md.com 2020年6月1日 《湖南中医药大学学报》 20206
     2.3 网络的构建及分析

    将左金丸靶点基因与胃癌靶点基因数据导入在线软件Venny 2.1.0绘制韦恩图。通过韦恩图(见图1)分析发现,左金丸靶点与胃癌靶点交集靶点基因共68个,左金丸作用于胃癌靶基因映射率为3%,提示左金丸存在确切防治胃癌的作用靶点,对胃癌具有一定特异性的防治作用。利用Cytoscape 3.7.1软件构建左金丸的化合物-作用靶点-疾病(胃癌)三者相互关系网络,见图2。该网络图生动明了地展示了左金丸的各成分、各靶点之间的相互联系及多成分、多靶点相互作用的复杂网络关系,充分体现了左金丸治疗胃癌多途径、多环节、多靶标、协同作用、整体调节的作用特点。

    2.4 靶点蛋白相互作用网络(PPI网络)构建及关键靶点筛选

    本研究使用在线工具STRING构建蛋白相互作用网络(PPI网络),见图3。在此基础上,利用Cytoscape 3.7.1的软件的cytohubba插件,通过Degree、EPC、BottleNeck等12种网络结构和节点间加权重联系的计算分析算法 ......
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