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编号:13793770
巴戟天-苍术药对治疗青少年抑郁症的网络药理学研究(3)
http://www.100md.com 2020年11月1日 《湖南中医药大学学报》 202011
     2.3 构建成分-靶点网络

    将2.1所得的主要活性成分及作用靶点,运用Cytoscape 3.7.2軟件构建成分-靶点网络,见图1。通过Network Analyzer插件进行网络拓扑分析得出共有263个节点和475条边,其中平均自由度为3.529。20个活性成分中作用靶点超过2个的有18个,其中汉黄芩素(wogonin)degree最大,与57个靶点相连,β-谷甾醇(beta-sitosterol)、油酸乙酯[ethyl oleate (NF)]分别与54、43个靶点相连,表明汉黄芩素、β-谷甾醇和油酸乙酯是巴戟天-苍术药对中的关键活性成分。

    2.4 药物与疾病PPI网络的构建

    将映射得到的37个关键靶点导入String平台进行靶点扩增,并得到预测PPI关系网,将关系网数据导入Cytoscape软件进行拓扑分析,得到PPI网络(见图2),结果表明,预测核心靶点共46个,且PPI网络有46个节点,729条边。根据度值、BC、CC确定核心靶点,按照度值排列,前10位为丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、肿瘤蛋白P53(TP53)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、淀粉样β前体蛋白(APP)、趋化因子配体8(CXCL8)、白蛋白(ALB)、白细胞介素6(IL-6)、原癌基因非受体酪氨酸激酶(SRC) ......
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