黄至澄，徐黔宁，闫李侠，陈保文，王国治

    (1、台州市第一人民医院，浙江 台州 318020；2、中国药品生物制品检定所，北京 100050)

    常见分枝杆菌种内不同株之间16S rRNA基因和16S-23S rRNA ITS序列分析结果的比较

    黄至澄1，徐黔宁1，闫李侠，陈保文2，王国治2

    (1、台州市第一人民医院，浙江 台州 318020；2、中国药品生物制品检定所，北京 100050)

    目的针对常见分枝杆菌不同株对其基因序列进行分析，比较分析结果。 方法 利用16S rRNA Gene和16S-23S rRNA ITS(转录间隔区序列)分析法分别对97株共7种DSMZ/ATCC引进的常见分枝杆菌进行种内不同株之间基因差异性分析，对比两种分型结果的异同。结果16S rRNA基因可将13株草分枝杆菌分为3个型别，18株偶发分枝杆菌分为6个型别，17株耻垢分枝杆菌分为4个型别，8株戈登分枝杆菌分为3个型别，9株龟分枝杆菌龟亚种分为3个型别，15株堪萨斯分枝杆菌分为2个型别，17株产鼻疽分枝杆菌分为1个型别；而16S-23S rRNA ITS可依次将上述分枝杆菌分为3个、15个、7个、3个、4个、3个、5个型别。结论16S rRNA Gene分析和16S-23S rRNA ITS分析均是分枝杆菌基因型分析的可靠方法，此外，16S-23S rRNA ITS的种内多态性高于16S rRNA Gene。

    分枝杆菌；16S rRNA；16S-23S rRNA ITS(转录间隔区)；基因型

    16 S rRNA基因作为原核生物分类的分子标志，已得到广泛应用，但因序列较长，直接测序困难，常以16S rRNA部分片段作为细菌鉴定标志。16S-23S rRNA ITS(转录间隔区)序列，进化速率比16S rRNA大10倍，在细菌的不同属种中拷贝数、碱基排列顺序以及内含的tRNA基因的数量和种类不同，序列大小比16S rRNA更具直接测序优势。如果两种结合，菌种鉴定效果较好。这种方法对于分枝杆菌同样适用。但是，现在较少有将两者结合鉴定种内参考菌株，它们对种内不同株的鉴别效果还不明确，且少数分枝杆菌的16S rRNA和部分16S-23S rRNA ITS没有在基因库中公布[1] ......