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编号:12464879
应用16SrRNA基因序列分析快速鉴定临床标本中的革兰氏阳性杆菌(1)
http://www.100md.com 2014年3月5日 姚纲 胡红焱 梁慧等
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    参见附件(3131KB,3页)。

     [摘要] 目的 探索一种快速鉴定临床标本中革兰氏阳性杆菌的方法。 方法 利用PCR技术扩增待检菌株的16 S rRNA基因序列,通过分析待检菌株的16 S rRNA基因序列对其进行鉴定。 结果 5株待检菌株的16 S rRNA基因序列均成功扩增,其中4株的16 S rRNA基因序列与基因库中已注册的核酸序列相似率达99.9%以上,将其鉴定到种的水平,1株的16 S rRNA基因序列与基因库中雷弗森菌属的核酸序列相似率为97.09%,将其鉴定为雷弗森菌属。 结论 应用16 S rRNA基因序列分析可快速、准确地鉴定临床标本中的革兰氏阳性杆菌。

    [关键词] 16 S rRNA基因;细菌鉴定;革兰氏阳性杆菌

    [中图分类号] R446.5 [文献标识码] A [文章编号] 1674-4721(2014)03(a)-0094-03

    近年来,随着人口老龄化、免疫损害宿主增加等因素的影响,革兰氏阳性杆菌感染的发病率有升高趋势[1-3]。常见的革兰氏阳性致病杆菌有单核细胞增生性李斯特菌、棒状杆菌、红斑丹毒丝菌、诺卡菌、产气荚膜梭菌、艰难梭菌以及炭疽杆菌等。革兰氏阳性杆菌感染其表型特征的敏感性及特异性较差,通过常规检验手段对其进行快速、准确的鉴定比较困难。2012年3~10月,本研究从临床标本中相继分离出5株革兰氏阳性无芽胞杆菌。为了快速、准确地鉴定这些菌株,笔者利用PCR技术对其16 S rRNA基因进行扩增,然后通过16 S rRNA基因序列分析将其鉴定至属或种的水平。

    1 材料与方法

    1.1 材料

    1.1.1 菌株 5株革兰氏阳性杆菌均分离自北京武警总医院各科临床标本,菌株编号分别为QC0411、QC0823、Y0720、Z0802、20983。

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