当前位置: 首页 > 期刊 > 《中国当代医药》 > 2019年第14期
编号:13378490
CLCA4基因在头颈部鳞状细胞癌中的表达与其临床意义(2)
http://www.100md.com 2019年5月15日 《中国当代医药》 2019年第14期
     1材料与方法

    1.1头颈部鳞状细胞癌组织中CLCA4的信息提取

    552例头颈部鳞状细胞癌患者组织样本来源于癌症和肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)(https://tcga-data.nci.nih.gov/tcga/),时间截止至2018年10月。下载并预处理头颈部鳞状细胞癌相关数据集的mRNA表达资料,在R语言安装edgeR包的条件下,分析CLCA4的表达情况。通过LinkedOmics(http://www.linkedomics.org/)对头颈部鳞状细胞癌分析CLCA4基因。

    1.2头颈部鳞状细胞癌组织中与CLCA4相关性最高的100个基因的富集分析

    头颈部鳞状细胞癌中CLCA4相关基因则通过Spearman Correlation test计算,并以热图与火山图展示。利用在线网站Metascape(http://metascape.org/)进行基因本体(GO)分析,京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。以判定预后基因主要影响的生物学功能或者通路 ......
上一页1 2 3下一页

您现在查看是摘要页,全文长 4272 字符