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编号:12524291
双歧杆菌Ⅱ型毒素—抗毒素系统—MazEF的分子进化分析(1)
http://www.100md.com 2014年12月5日 韦艳霞 刘佃滨 郑纪伟 等
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     【摘要】 目的:对双歧杆菌属编码的Ⅱ类毒素-抗毒素(TA)系统MazEF进行分子进化分析。方法:利用PSI-BLAST在NCBI中搜索获得双歧杆菌编码的MazF分子序列,在NCBI蛋白数据库、核酸数据库分别下载其他菌属基因组编码的MazF蛋白序列和本研究所涉及菌属的16 S rRNA序列,应用Clustal X2和MEGA4软件对MazF做分子进化分析。结果:共搜索到双歧杆菌株染色体编码毒素蛋白MazF 26个。分子进化分析显示:整个双歧杆菌属的MazF保守性不好;MazF与16 S rRNA的共进化仅在个别菌种中发现,大部分MazF的聚类结果与相应菌种16 S rRNA的聚类结果不同。结论:双歧杆菌中的TA系统MazEF可能是通过基因的水平转移整合入基因组中,属于菌株非核心基因组部分。

    【关键词】 MazEF; 毒素-抗毒素系统; 分子进化; 双歧杆菌

    Ⅱ类毒素-抗毒素(TA)系统,最早在1982年于大肠埃希菌的低拷贝质粒中发现。其后发现,TA系统同样存在于细菌染色体上,也存在于一些外源DNA岛如噬菌体、转座子、超级内含子和质粒中,由于近年来发现其参与细菌的多种应激调控过程而被广泛关注[1]。生物信息学分析发现:多达750个细菌和古细菌的基因组中存在Ⅱ类TA系统;自生微生物的基因组中一般含有多个Ⅱ类TA系统编码基因,而在严格的胞内微生物基因组中未发现Ⅱ类TA系统编码基因;以上证据提示Ⅱ类TA系统对微生物的生存具有重要作用。主流观点认为:TA系统可能作为一个特殊的压力反应原件,在细菌对不利环境的应激调控过程中发挥重要作用[2-3] ......

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