杨从影,唐莉华,孙龙华,罗 江,黄学娣

    (1.江西省中西医结合医院 药物临床试验机构办公室,江西 南昌 330002;2.南昌大学第一附属医院 呼吸内科,江西 南昌 330006)

    胃癌(gastric cancer,GC)起源于黏膜上皮细胞,是常见的消化道恶性肿瘤之一,是全球第四大常见癌症,我国发病率位居世界第二[1-2]。中医认为,胃癌是素体脾胃亏虚,复加外感六淫,饮食失调、情志紊乱等多种因素,导致气血痰湿毒等多种病理产物夹杂的结果,归纳为痰气瘀滞、胃热伤阴、寒凝气滞[3];治疗多以化痰解毒、健脾益气、温中散寒为主,且不良反应少,契合胃癌复杂的病情特点[4-6]。

    参芪白石汤(SBD)由党参、黄芪、白术、白英、白花蛇舌草等中草药组成,有健脾利湿、清热解毒之功效,用于晚期胃癌、正虚邪实者,可随症加减[7]。本研究通过数据挖掘、GEO数据库和分子对接的网络药理学方法,探讨SBD治疗胃癌GC的作用机制。

    1 材料与方法

    1.1 SBD有效成分及靶点挖掘 通过查阅文献[8]可知,SBD由白花蛇舌草、白术、黄芪、党参、七叶一枝花、仙鹤草、石见穿、薏仁、白英9味中药组成,利用中药系统药理学分析平台 TCMSP( http: // lsp. nwu. edu. cn / tcmsp. Php)设置口服生物利用度 ( OB) ≥ 30% 、类药性 (DL) ≥0.18筛选,并结合《中药大辞典》进行补充,最后利用有机小分子生物活性数据 Pubchem ( https: // pubchem. ncbi. nlm. nih. gov / ) ,查询筛选出的化合物结构式,并复制化合物的 SMILES 表达式,通过SIB分子构效相似性分析平台(http://www.swisstargetprediction.ch/)预测靶点蛋白,然后使用Uniprot(http://www.uniprot.org)数据库将所得靶点蛋白进行规范化处理。

    1.2 GC差异表达基因的筛选 从 GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)搜索组织来源为人,同时含有胃癌组织和正常胃组织样本的基因表达数据集,筛选出 GSE118916探针芯片数据集,包含15个胃癌组织和 15个正常胃组织样本基因表达谱,并利用 R语言的Limma 软件包对芯片进行基因差异分析,用python软件绘制火山图,根据相关参数P.adjust1或0.4),其他参数选择默认值,得到交集靶蛋白PPI网络图 ......