2.2 基因型耐药检测

    基因型耐药检测基于分子生物学方法，扩增基因组中耐药相关的特定区域目的基因片段并进行序列测定，利用数据库进行结果解释，操作简单，所用时间短。标准的基因型耐药检测的对象主要是蛋白酶和逆转录酶区域，随着更多不同靶向药物如整合酶抑制剂、CCR5拮抗剂等的应用，检测范围也在不断拓展[12]。Kagan等[13]在CCR5/CCR2双重拮抗剂的临床Ⅱ期试验中比较了基因型和表型耐药检测，发现二者具有较高的一致性，而基因型耐药检测在检测周期和成本上具备优势。

    常用的HIV耐药基因型检测商品化试剂盒有TRUGENETM和ViroSeqTM，具备对应的耐药数据库，检测成本昂贵。实验室自建的In-house方法一般用巢式PCR方法进行扩增，结果分析常用斯坦福大学耐药数据库(Stanford HIVdb)，在常规化推广中表现出更好的性价比[14]。李晶等[15]对In-house方法和TRUGENETM、ViroSeqTM两种商品化试剂盒的检测结果比较研究发现，三种方法的一致率达到99.42%(2933/2950)。病毒载量达到1000拷贝/毫升被认为是推荐进行耐药检测的阈值 ......