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编号:13133340
系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞超保守区域转录表达水平分析(2)
http://www.100md.com 2014年4月1日 邱劲军等
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    参见附件。

     1.3 DNA芯片 采用Arraystar公司的人T-UCR芯片分析人体T-UCRs表达水平。在481个UCRs超保守区域的两端分别添加1 kb的片段,然后用40 bp的特异性探针标记,从而可以准确的检测T-UCR和发现新的T-UCR。接着,在芯片中加入特定的外显子或探针,精确地检测到153个潜在的T-UCRs,这些T-UCRs可以与数据库,如RefSeq、UCSC knowngenes和Ensembl进行比对。最后,基因特异性探针标记的UCRs检测到1 809个基因,由此可探索T-UCRs和它们近端蛋白质编码基因之间的关系。

    1.4 RNA标记和芯片杂交

    1.5 数据分析

    2 结 果

    3 讨 论

    在人体组织中,很大一部分的UCRs都会发生转录(T-UCRs),并且它们的表达水平与组织特异性相关联。T-UCRs只有一条主链会发生转录,而且只有9%的T-UCRs会发生正反转录[13]。准确测定人类所有的481T-UCRs方法有芯片测定、Northern印迹法、反转录实时定量PCR[14]和线性恒温Ribo-SPIA? RNA扩增法[15]。因为标本量小而且结果的稳定性和准确性,所以这对于临床方面的转录表达调控研究具有特别意义 ......

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