据《清史稿·职官志》，太医院的人事编制是，由管理院事王大臣统领院务，置院使1人，左右院判各1人，其属下有御医13人，吏目26人.医士20人.医生30人。

    太医院中院使的职位，由左院判来升补，左院判由右院判转补，右院判则由御医升补。御医、吏目、医士等官，先要由各省选举精通医理的人上报太医院，再由太医院来选拔。

    太医院作為培养人才的学校，乾隆二年(1737年)，设有教习厅，在御医、吏目内，择品学兼优者各二人讲课，并批阅医士以下月课，并准太医院医官子弟保送教习厅学习；同治五年(1866年)，改教习厅为医学馆，院内派教习(老师)三人，收掌三人，仅令医士、恩粮、肄业生朔、望日(即每月初一、十五)各写论文一篇 ......