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编号:610952
NPEPPS基因在强直性脊柱炎发病机制中的功能基因组学分析
http://www.100md.com 2021年4月13日 温州医科大学学报 2021年第3期
氨基,等位基因,基因型,1对象和方法,2结果,3讨论
     童筱君,李辰璐,王国芬,朱小春,王晓冰

    1.台州市中心医院(台州学院附属医院) 风湿免疫科,浙江 台州 318000;2.温州医科大学附属第一医院 风湿免疫科,浙江 温州 325015

    强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)是一种慢性炎症性自身免疫性疾病,常导致脊柱疼痛、僵硬及终末期关节融合。AS的发病率依种族而异,在中国约为0.3%[1]。AS病因未明,被认为与遗传和环境相关[2-3],尤其是遗传因素在AS发病中起着重要作用,其遗传度超过90%[4-5]。

    人类白细胞抗原(human leukocyte antigen B27,HLA-B27)是迄今为止所知的复杂疾病中相关性最强的一个等位基因[6]。国际AS遗传学联盟发现除了HLA-B27外,还有31个不同的基因位点被确定与AS相关,大部分位于主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)区域。四种编码位点的氨基肽酶在MHC I-肽复合物抗原递呈通路中发挥作用[7],可能在AS的发病机制中起重要作用。国内外已有大量关于ERAP1 和ERAP2 两个氨基肽酶编码位点的研究,以及将相关研究结果转化为临床治疗的应用[7-8]。而另一个与疾病相关的氨基肽酶编码位点NPEPPS 在AS中的后续研究尚不足。本项目利用免疫芯片的数据和二代RNA-Seq技术对疾病相关NPEPPS基因的遗传变异进行eQTL分析,探讨NPEPPS在AS发病和进展中的作用。

    1 对象和方法

    1.1 对象 选取温州医科大学附属第一医院风湿免疫科收治的54例AS患者作为AS组,78例健康对照者为对照组。AS组所有患者均符合1984年纽约分类标准[9]。本研究经温州医科大学附属第一医院伦理委员会批准,所有患者签署了知情同意书。

    1.2 免疫芯片基因定型 从入选者5 mL全血中分离出外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs),提取DNA,用Illumina平台进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism ......

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