基于生物信息数据库分析含DEP结构域的蛋白质1在子宫内膜癌中的表达和预后意义
生存率,1材料与方法,2结果,3讨论
赵车冬,王敏娟,周 萍,陈 葳(西安交通大学第一附属医院 检验科,陕西 西安 710061)
最新的癌症统计数据显示,子宫内膜癌(Endometrial cancer,EC)在美国女性常见肿瘤发病率中排名第4,也是女性生殖系统最常见的一种上皮性恶性肿瘤,2021年预计新发病例达66 570例,死亡病例达12 940例[1]。子宫内膜癌的发病机制复杂,微卫星不稳定增加,p53基因突变以及多种信号通路的异常均可影响子宫内膜癌的进展和预后。但是目前缺乏对其早期诊断和预后判断的有效生物标志物。因此筛选生物标志物对预测EC的转移和复发,有效监测EC患者的预后至关重要。
在前期的工作中,我们通过生物信息学方法筛选了子宫内膜癌相关的生物标志物,结果提示含DEP 结构域的蛋白质1 (DEP domain containing 1,DEPDC1) 可能是子宫内膜癌的发生发展过程中一个关键基因,可以作为子宫内膜癌新的生物标志物和潜在治疗靶点[2]。DEPDC1是一个新的肿瘤相关基因。Kanehira等首先发现DEPDC1在膀胱癌组织中高表达,利用siRNA敲低DEPDC1基因表达,可以抑制膀胱癌细胞的生长[3]。DEPDC1基因编码的蛋白含有DEP结构域,可能作为转录辅助抑制因子参与转录调控。近年来的研究表明,DEPDC1在包括肝癌[4]、乳腺癌[5]等多种肿瘤中呈现过表达状态,可能成为这些恶性肿瘤分子靶向治疗的新靶点。但是DEPDC1在子宫内膜癌中的作用尚未明确。本研究基于多个生物信息数据库探讨DEPDC1基因在子宫内膜癌中的表达和预后意义。
1 材料与方法
1.1 阿拉巴马癌症数据库(University of alabama cancer,UALCAN)分析 UALCAN(http://ualcan.path.uab.edu)[6]是一个综合的交互式的在线网络资源,用于分析癌症组学数据。输入基因名称“DEPDC1” ......
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