川贝母转录组密码子使用偏好性分析(3)
2.4 关键酶基因异源表达的稀有密码子分析
根据 Codon Usage Database 数据， 大肠杆菌中最稀有的6个密码子分别为AGG，AGA，CGA，CUA，UGU，AUA，其中有1个稀有密码子(AGA)是川贝母偏好使用的密码子。如果需要克隆表达的川贝母基因含有较多的AGA密码子，则该基因可能会在大肠杆菌中表达困难。酿酒酵母中最稀有的6个密码子分别为：CGG，CGC，CGA，UGC，CCG，CUC，不含有川贝母偏好使用的密码子。因此，与酵母相比，大肠杆菌的密码子使用偏好性与川贝母的略有差异，但差别别大。
目前，还未有川贝母生物碱合成相关基因被克隆鉴定的报道。川贝母所含生物碱属于甾体生物碱，环阿屯醇是植物甾体类物质生物合成的共同的前体物质，CYP450基因家族的基因通过氧化还原反应对环阿屯醇进行修饰，完成生物碱合成。根据川贝母转录组数据的注释信息，发现可能参与生物碱合成的相关基因及CYP450基因共26个(表3)。为了更直观地预测川贝母基因在宿主大肠杆菌和酵母中的表达情况，选取这26个关键酶编码基因 ......
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根据 Codon Usage Database 数据， 大肠杆菌中最稀有的6个密码子分别为AGG，AGA，CGA，CUA，UGU，AUA，其中有1个稀有密码子(AGA)是川贝母偏好使用的密码子。如果需要克隆表达的川贝母基因含有较多的AGA密码子，则该基因可能会在大肠杆菌中表达困难。酿酒酵母中最稀有的6个密码子分别为：CGG，CGC，CGA，UGC，CCG，CUC，不含有川贝母偏好使用的密码子。因此，与酵母相比，大肠杆菌的密码子使用偏好性与川贝母的略有差异，但差别别大。
目前，还未有川贝母生物碱合成相关基因被克隆鉴定的报道。川贝母所含生物碱属于甾体生物碱，环阿屯醇是植物甾体类物质生物合成的共同的前体物质，CYP450基因家族的基因通过氧化还原反应对环阿屯醇进行修饰，完成生物碱合成。根据川贝母转录组数据的注释信息，发现可能参与生物碱合成的相关基因及CYP450基因共26个(表3)。为了更直观地预测川贝母基因在宿主大肠杆菌和酵母中的表达情况，选取这26个关键酶编码基因 ......
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