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编号:13450712
生物信息学分析筛选肺腺癌靶基因及评估预后的价值(3)
http://www.100md.com 2019年6月4日 《医学信息》 2019年第22期
     为了进一步筛选关键基因,本研究利用string构建了一个由224个节点、447条边组成的蛋白质-蛋白质互作网络,利用cytoscape对该网络可视化,并用cytoHubba插来筛选目的基因。根据6种不同算法得到每种算法的前10个关键基因,再对这6种方法得到的关键基因取交集,分别为IL6、VWF、PECAM1、SPP1、CDH5、CXCL12、TIMP1、CLDN5关键基因,其中VWF、SPP1、CDH5已在其他文献中有过报道[8,9]。本研究对PECAM1进行生存曲线分析,结果表明PECAM1的表达与LUAD患者的预后有关(P<0.05),低表达的PECAM1患者的预后更差。另有研究发现,PECAM1在多种肿瘤中与正常组织存在差异表达,如卵巢癌[10]、淋巴瘤[11]、肝癌[12]、胃癌[13]、白血病[14]、结肠癌[15]等 ......
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