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编号:13450792
生物信息学分析筛选肺腺癌靶基因及评估预后的价值(1)
http://www.100md.com 2019年6月4日 《医学信息》 2019年第22期
生物信息学分析筛选肺腺癌靶基因及评估预后的价值,差异表达基因,生物标志物
     摘要:目的 基于生物信息学分析筛选肺腺癌靶基因及评估预后价值。方法 对三个数据集(GSE118370、GSE32863、TCGA-LUAD)分别使用limma和edgeR包筛选出肺腺癌差异表达基因,对共同差异基因进行功能富集分析,通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,采用Cytoscape进行可视化分析并用其插件cytoHubba来筛选关键基因,采用Kaplan-Meier曲线进行总体生存分析。结果 共224个共同差异基因,其中上调基因34个,下调基因190个。共同差异基因在血管生成、白细胞调节、免疫反应等生物学过程富集。通过从PPI网络中筛选出8个关键基因 ......
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