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几种单头螨线粒体基因组提取方法的比较(3)
http://www.100md.com 2015年6月25日 《中国医学创新》 2015年第18期
     Chelex-100是一种由苯乙烯和苯二乙烯组成的一种金属离子螯合剂,可高选择性地去除样品和缓冲液中的金属离子,避免煮沸过程中模板DNA的降解。被广泛应用于医学微量血痕DNA以及微生物DNA提取[23-24]。与经典的酚氯仿抽提法相比,Chelex-100法未用苯酚除蛋白质,也未用乙醇沉淀DNA,所以DNA中仍混有少许蛋白质,但PCR反应对模板纯度的要求较低,其结果是稳定可靠的,其特异性和敏感性可与酚氯仿法相媲美[25]。Chelex-100法与传统的酚氯仿抽提法比较,省去了复杂的抽提纯化过程,节省了时间。此外本法单头螨即可获得可用于PCR反应的模板量,而酚氯仿抽提法在抽提纯化过程中DNA损失量较大,无法从微量样品中得到目的DNA。再者,Chelex-100试剂无毒,而酚和氯仿对人体有一定的毒性[26]。

    蛋白酶K法直接用蛋白酶K消化被充分研磨的极微量样品,从而得到适合于PCR反应的DNA模板。因所需的样品量极微小,所得的PCR产物经进一步纯化后可以达到较高的纯度,适用于RAPD、RFLP、序列测定、克隆等试验。该方法除具备Chelex-100法的优点外,成本较Chelex-100法低廉,而且提取效率高,但是所获得的模板量较Chelex-100法少。综合Chelex-100法和蛋白酶K法各自的优缺点,当需要大量模板时可使用Chelex-100法,而只需要获得少量模板可采用蛋白酶K经济、快捷。
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    本实验采用活体的螨类标本,而对于不同保存方法和不同保存时间的螨类标本,上述3种方法的取提效果还有待进一步的研究。

    参考文献

    [1]李朝品,武前文.房舍和储藏物粉螨[M].合肥:中国科技大学出版社,1996:267-271.

    [2]休斯 A M.贮藏食物与房舍的螨类[M].忻介六,沈兆鹏,译.北京:农业出版社,1983:194-215.

    [3]黄斌,王朋朋,吴淑庄,等.血清尘螨特异性IgE检测在小儿哮喘防治中的应用研究[J].中国医学创新,2014,11(7):25-26.

    [4]陈国华,刘婧,付承,等.粉尘螨滴剂治疗尘螨过敏性支气管哮喘疗效观察[J].中外医学研究,2014,12(23):105-107.
, 百拇医药
    [5] Bains P,Dogra A.Skin prick test in patients with chronic allergic skin disorders[J].Indian J Dermatol,2015,60(2):159-164.

    [6] Palopoli M F,Minot S,Pei D,et al.Complete mitochondrial genomes of the human follicle mites Demodex brevis and D.folliculorum:novel gene arrangement,truncated tRNA genes,and ancient divergence between species[J].BMC Genomics,2014,16(15):1124.

    [7] Halász J,Kodad O,Heged?s A.Identification of a recently active Prunus-specific non-autonomous Mutator element with considerable genome shaping force[J].Plant J,2014,79(2):220-231.
, 百拇医药
    [8]吴太葆.基于形态特征和 COI 基因的粉螨重要类群系统发育研究 (蜱螨亚纲:粉螨亚目)[D].南昌:南昌大学,2007.

    [9]邹志文,张素卿,辛天蓉,等.一种简易的昆虫基因组DNA提取方法[J].南昌大学学报(理科版),2011,35(6):564-567.

    [10]田英芳,黄刚,郑哲民,等.一种简易的昆虫基因组DNA提取方法[J].陕西师范大学学报(自然科学版),1999,27(4):82-84.

    [11]温硕洋,何晓芳.一种适用于昆虫痕量DNA 模板制备的方法[J].昆虫知识,2003,40(3):276-279.

    [12] Gissi C,Iannelli F,Pesole G.Evolution of the mitochondrial genome of Metazoa as exemplified by comparison of congeneric species[J].Heredity,2008,101(4):301-320.
, 百拇医药
    [13] Wang I J.Recognizing the temporal distinctions between landscape genetics and phylogeography[J].Mol Ecol,2010,19(13):2605-2608.

    [14] Nabholz B,Jarvis E D,Ellegren H.Obtaining mtDNA genomes from next generation transcriptome sequencing:a case study on the basal Passerida (Aves:Passeriformes) phylogeny[J].Mol Phylogenet Evol.,2010,57(1):466-470.

    [15] Masta S E.Mitoehondrial rRNA secondary structures and genome arangements distinguish chelicerates:comparisons with a harvestman (Arachnida:Opiliones:Phalangium opilio)[J].Gene,2010,449(1-2):9-21., 百拇医药(湛孝东 李朝品 席贻龙)
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